Chinonso, éleveur de volailles au Nigeria, croise une jeune femme sur le point de se précipiter du haut d'un pont. Terrifié, il tente d'empêcher le drame et parvient à sauver la malheureuse Ndali. Cet épisode va les lier indéfectiblement. Mais leur union est impossible : Ndali vient d'une riche famille et fréquente l'université, alors que Chinonso n'est qu'un modeste fermier... Pour devenir digne de celle qu'il aime, le jeune homme décide de partir étudier à l'étranger, en Crête précisément, scellant ainsi le sort tragique de sa relation avec Ndali. La prière des oiseaux est une épopée bouleversante à travers l'Afrique et l'Europe, où le destin joue un rôle central. Chinonso et Ndali pourront-ils y échapper ?