Nene a réussi à s'échapper de la grotte sous la Maison Rouge. Retrouvant Kô et le petit garçon, les deux amis comprennent qu'il s'agit en fait d'une version plus jeune de Tsukasa, le frère d'Hanako. L'origine de la tragédie familiale des Yugi est enfin dévoilée ! Pour secourir leurs amis bloqués de l'autre côté, ils devront déjà parvenir à s'échapper de la Maison. Mais ce manoir maudit ne compte pas laisser partir son jeune occupant si facilement...